Le collège accueille les élèves en enseignement direct de la 6ème à la 3ème. Comme pour le premier degré, depuis la convention passée entre le Ministère de l'Education Nationale Chypriote et l'AEFE, l'établissement propose deux cursus au choix : un parcours hellénophone ou bien un parcours francophone.
L'EFCN est engagée dans une politique des langues efficace :
- Les élèves suivent un enseignement en français.
- Apprennent depuis la maternelle le grec (section hellénophone ou francophone).
- L'anglais depuis le CP.
- Ils se voient proposer à l'entrée en 5ème une nouvelle langue étrangère (l'allemand ou l'espagnol).
Ces quatre années passées au collège ont pour finalité l'obtention du premier examen du cursus français : le Diplôme National du Brevet (DNB).
